该可授权扰动数据集将整合转录组与蛋白质组分泌组数据,用于解析人体免疫应答机制
可扩展且易于获取的单细胞测序解决方案的领先提供商、QIAGEN旗下公司Parse Biosciences与高通量蛋白质组学分析领军企业Nomic Bio今日宣布达成合作,共同生成Cascade——一个包含1亿细胞的基础性数据集,用于解析人体免疫应答机制。该数据集的规模与深度将为制药合作伙伴提供细胞与蛋白层面的免疫生物学洞察,提升其识别和验证新药靶点的能力。
Cascade已获得多家领先制药与生物技术公司的基础合作伙伴承诺,包括GSK、Pfizer、Sanofi、Graph Therapeutics和Turbine,彰显了药物研发领域对大规模、多模态免疫数据的需求。
Cascade是一个多模态扰动数据集,旨在捕获免疫细胞在不同时间点对治疗的反应,是同类别中规模最大的AI就绪免疫建模资源。该数据集将整合1亿个单细胞RNA测序图谱与超过11,000份蛋白质组分泌组图谱,记录不同免疫细胞类型对超过15万种单独及组合性细胞因子与药物扰动条件的响应。通过在同一免疫应答过程中配对转录组与蛋白质组读数,Cascade将为研究人员提供前所未有的视角,揭示驱动人体免疫信号传导的机制,进而填补构建预测性虚拟细胞模型的关键数据空白。
单细胞RNA测序数据的生成将在Parse的GigaLab中进行,该高通量服务实验室每年可对数以十亿计的细胞进行分析。这些数据将与Nomic的Omini 1000平台生成的蛋白质组分泌组数据相匹配,该平台将对所有样本中超过1000种分泌蛋白进行测量。
Parse Biosciences联合创始人兼首席技术官Charlie Roco表示:“生物AI建模正遭遇数据瓶颈。尽管在药物研发中扮演着核心角色,但可用于衡量人类对细胞因子和其他药物等关键扰动的免疫反应的数据却少得惊人。Cascade是揭示这些相互作用的关键一步,得益于此,我们预计将显著提升合作伙伴AI模型的预测能力。”
Nomic Bio联合创始人兼首席执行官Milad Dagher表示:“免疫生物学的AI模型不仅需要捕获细胞状态的变化,还需要捕捉细胞用于通信的蛋白质信号。Cascade将定量、时间分辨的蛋白质测量与单细胞数据结合在一起,其处理规模能够帮助研究人员构建免疫应答的发展模型,并预测其在新的扰动条件下如何变化。”
关于Nomic Bio
Nomic的创立宗旨是让生物学测量更加简便,并通过使蛋白质组学变得易于获取、可扩展和常规化,帮助科学家延长人类寿命。凭借其专有的nELISA®技术,Nomic提供大规模、定量且具有成本效益的蛋白质数据,以加速发现、开发与转化进程。其端到端服务融合了灵活的内容、专业的支持与分析就绪的输出,使蛋白质组学能够无缝整合到药物与生物标志物开发的各个阶段。Nomic的使命是让蛋白质组学在现代生物学中得到普及应用。如需了解更多信息,请访问nomic.bio或在LinkedIn上关注我们。
关于Parse Biosciences
QIAGEN旗下的Parse Biosciences是一家全球性的生命科学公司,以提速人类健康和科学研究为使命。公司让研究人员能够以前所未有的规模和便利进行单细胞测序,借助创新性的实验方法在癌症治疗、组织修复、干细胞治疗、肾脏和肝脏疾病、大脑发育和免疫系统领域实现了突破性的进展。
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